평범한 마을 **‘사쿠라 뉴타운’**에 사는, 아주 평범한 초등학교 5학년생 ‘아마노 케이타(케타)’. 어느 여름날, 그는 하얗고 이상한 생물 **‘위스퍼’**를 만나게 된다. 그날 이후 케타를 따라다니게 된 위스퍼의 정체는, 놀랍게도 요괴였던 것이다! 위스퍼에게서 신비한 시계 **‘요괴 워치’**를 건네받은 케타는 그날부터 도시 곳곳에 숨어 있던 요괴들이 보이게 되어버린다…! 사실, 일상 속에서 일어나는 온갖 골치 아픈 일들은 모두 요괴들의 짓이었다!? 케타는 말썽을 일으키는 요괴들을 설득하거나, 때로는 싸움을 통해 문제를 해결한다. 그리고, 그렇게 만난 요괴들과 친구가 되어 가는 이야기!