여기는 음악이 넘치는 마을, 카온 마을 이 마을에서 자란 히비키와 카나데는 어릴 적부터 언제나 함께였던 소꿉친구. 하지만 중학생이 되고 나서는 왠지 얼굴을 마주하면 싸움만 하고... 그런 두 사람에게 음악의 나라 메이저 랜드에서 온 요정 <하미>가 나타났다! 하미는 전설의 악보에 적혀있는 <행복의 멜로디>를 <불행의 멜로디>로 바꾸려고 하는 「마이너 랜드의 왕 메피스토」로부터 세계를 보호하기 위해 두 사람에게 프리큐어로 변신해 달라고 부탁한다. 언제나 전혀 의견이 맞지 않는 소리와 연주이지만, 두 사람의 정의의 마음이 하나가 되었을 때, 프리큐어로 변신한다!