1999년, 나가노현 마츠시로에 있는 일본의 피라미드 *‘미나카미야마’*에 우뚝 솟은 사립 발트슈타인 학원. 이곳에서는 무언가에 이끌리듯 연이어 오컬트 현상이 발생하고 있다. 그로 인해 사람들은 이 학교를 **"오컬트 학원"**이라 부른다. 학장은 오컬트 연구에 인생을 바쳤으며, 학생들 또한 매일 학업과 연구에 힘쓰고 있다. 어느 날, 학장이자 아버지가 갑작스레 사망하고, 오컬트를 몹시 싫어하는 외동딸 진다이 마야가 학원을 찾는다. 그곳에서 마야는 "2012년에서 왔다"고 주장하는 자칭 타임 에이전트, 그리고 한때 '숟가락 휘기 소년'으로 이름을 알렸던 우치다 후미아키와 만나게 된다. 학원 내에서 발생하는 다양한 괴현상들과 마주하면서, 후미아키가 왜 1999년으로 타임슬립하게 되었는지 그 진실이 서서히 밝혀지기 시작하는데…