24세기 초두, ‘분쟁 근절’을 제창하는 사설 무장 조직 솔레스탈 비잉은 인간형 기동병기 건담을 필두로 세계 각지의 분쟁에 무력 개입을 실시했었다. 연이은 전투 속에서 진정한 혁신자(이노베이터)로 각성한 솔레스탈 비잉의 건담 마이스터 세츠나 F. 세이에이는 힘에 의한 통제로 인류를 통일하고 이끌고자 한 이노베이드 리본즈 알마크와의 사투에서 승리했다. 세계는 평화를 위한 의미 있는 걸음을 내딛기 시작하였고 그 뒷편의 그림자 속에서 솔레스탈 비잉은 비밀스러운 활동을 이어나간다. 그로부터 2년 후인 서기 2314년, 무력에 의지하지 않는 사회를 만들기 위해 온 힘을 쏟는 인류였지만, 다시 위기가 찾아온다. 130년 전에 폐선되었던, 생체 반응이 없는 목성 탐사선이 지구권에 접근해 왔던 것. 그것은, 인류의 존망을 건 싸움의 시작을 고하는 배였다. 세츠나는 새로운 위기 속에서, 스스로가 이룩한 진화의 진짜 의미와 직면한다. 과연, 이오리아 계획의 최종 단계란. 그리고, ‘다가올 대화’란 도대체 무엇인가?