서기 2042년, 지구에는 갑자기 미지의 거대 생물 ‘의태수’가 나타났고, 세계 각국에서 개발한 거대 로봇들과의 싸움이 벌어지고 있었다. 일본의 슈퍼로봇 ‘고단나’의 파일럿 사루와타리 고오(猿渡 ゴオ)는 후일 ‘거신전쟁’이라 불리는 보스 의태수와의 결전에서 파트너이자 연인인 미라 애커맨을 잃고 만다. 하지만 고오는 그 대신 한 소녀의 목숨을 구했다. 그 소녀의 이름은 아오이 안나…… 운 좋게도 인류는 싸움에서 승리했고, 5년이라는 세월이 흘렀다. 그러나 세계 각지에서는 아직도 의태수의 아종이 살아남아 있었고, 슈퍼로봇들의 싸움은 계속 이어졌다. 그리고 17세의 고교생이 된 안나는 고오와 재회하여 사랑에 빠졌고, 언제부터인가 두 사람은 결혼을 결심한다. 그러나 결혼식 당일, 일본에 의태수가 출현한다. 고오는 결혼식을 도중에 중단하고 고단나로 출격한다. 하지만 안나는 남편이 돌아오기를 그저 기다리는 소녀가 아니었다. 안나는 고단나의 파트너 로봇인 ‘네오 옥서’에 탑승해 자신도 의태수와의 싸움에 몸을 던진다. 과연 이 두 사람은 무사히 결혼할 수 있을 것인가? 그리고 세계의 평화는 지켜질 수 있을 것인가?