신서력이라 불리는 시대. 지구 연방 정부에 반기를 든 디바인 크루세이더즈와의 ‘DC 전쟁’, 그리고 외계인 에어로게이터와의 ‘L5 전역’이 끝난 지 반년 후……. 대전쟁으로 중추부와 요인을 잃은 지구 연방 정부는 조직 재편을 강요당했고, 코로니 총합부 대통령이었던 브라이언 미드크리드가 연방 정부 대통령에 취임한다. 그는 연방 의회에서 L5 전역의 정보를 공개하는데, 후에 ‘도쿄 선언’이라 불리게 될 이 발표를 통해 지구 외 지적 생명체의 존재가 공식 인정되고, 그들이 지구 인류에 위협이 될 것임이 시사된다. 더불어 미드크리드 대통령은 지구권의 일치를 호소하며, 연방군 조직 개혁과 군비 증강 계획인 ‘이지스 계획’을 발표한다. 이 계획 하에 인간형 기동 병기의 양산과 신형기의 개발, 지구권 방위망 강화 등이 진행된다. 하지만 그 이면에는 움직이는 자들이 있었다. 과거 비안 졸닥 박사가 이끌던 군사 결사 ‘디바인 크루세이더즈’, 통칭 ‘DC’의 잔당과, 연방 정부 및 연방군 내부에서 군사 정권 수립을 노리는 자들이다. 그러나 사람들은 아직 깨닫지 못했다. 진정한 적은 ‘매우 가까이 있으면서도 무한히 먼 세계’, 그리고 ‘정적의 세계’에서 찾아오고 있음을…….