젊은 닌자 키리가쿠레 사이조는 자신의 삶에서 의미와 방향을 찾고 있다. 어느 날 암살자들에게 쫓기는 이사나미를 만나 그녀의 목숨을 구하는 데 성공한다. 이사나미는 사이조에게 목적지에 도착할 때까지 자신의 호위 역할을 해 달라고 부탁한다. 그들이 사나다의 보호 구역에 도착하자, 사이조는 전설적인 닌자 집단의 리더 사스케 사루토비와 만난다. 사나다는 대담하고 재능 있는 닌자들을 모아 일본의 전쟁 시대를 끝내려 하고 있다. 한편, 이사나미의 신비한 숨겨진 힘이 서서히 드러나기 시작한다.
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