갈즈오름과의 최종 결전――프로젝트 리저렉션――을 완수한 셀레브런트들은 세계 각지의 잔존 부대와의 싸움을 계속하고 있었다. 셀레브런트로서 마이하마 서버를 지킨 ‘소골 쿄’는 눈이 내리는 겨울의 마이하마에서 눈을 뜬다. “계속 여름에 있었던 기분이 들어……” 기억의 결손에 혼란스러워하는 쿄 앞에 새로운 위협, 올타모다가 나타난다. 스스로를 ‘히카리타츠모노’라 부르는 ‘할 벨트’는 서브스탠스 쉐이드라 불리는 미지의 능력으로 공격해 온다. AI ‘루파’의 도움으로 지금까지의 기억을 다운로드한 쿄는 광대장비로 맞서 싸우게 되지만, 이는 서로의 세계와 존재를 건 싸움의 시작에 불과했다…….