21세기의 초, 가을 우치하마 지구의 우치하마 학원은 역대 최고조의 열기를 보이고 있었다. 집행회를 중심으로 개최되는, 각 문화 학회 최대의 볼거리·종합 학회. 그것은 신교사 건설과 함께, 폐교가 정해진 구교사에서의 마지막 축제였다. 각 문화 학회의 회장들을 시작으로 학생들은 총력을 기울여 이 마지막 문화제를 성공으로 이끌려 하고 있었다. 몇 번이나 상을 받고 있는 미술회의 전람회, 취주악회 총출연의 대공연회, 식물 유전자의 재편성으로 실적이 있는 생물학회. 실력 있는 학회가 참전을 자청할 때마다, 사기는 높아져 간다. 그리고──그 높은 사기는 주인공 아키야마 소우가 소속한 「천문학회」에게 또 한 이어졌다. 활동 내용 불명, 연구 미발표·지만 그들에겐 무엇인가 일어난다, 그들은 무엇인가 일으킬 수 있다. 그런 희망적 관측을 기본으로, 이런 천문학회에게 주어진 사명들 그것은 바로. “각 학회에 의한 과열된 축제 분위기 진압과 활동 장해물을 철거, 그리고 여름 전부터 시작된 이상 현상을 동반하는 어느 사건의 해결”이었다. 일어서는 교내 굴지의 빅 네임을 가진 학회 멤버. 교내의 소란의 중심에는 이 사람이 있다, 합기도의 달인·이며 천문학회 부장 하세쿠라 아이리. 2학년 대상 제33회·신부로 하고 싶은 여자, 부동의 1위 2학년 사사키 카오리. 시기에 어긋난 과묵한 전학생 후배, 후루카와 유이. 독설 여왕, 교사 브레이커·하나미야 나기사. 또 미국에서 온 교환학생·오사후네·KENNY·에이타로. 전교의 기대를 짊어지고, 마지막 문화제를 향해서 그들이 움직이기 시작한다── 그리고 아무 문제 없는 나날을 꿈꾸며 구교사 마지막 문화제를 준비하는 그들에게 그 사건은 갑작스럽게 다가온다.