근미래의 마을, 하트랜드 시티에서는 어른도 아이도 AR 듀얼에 열중하고 있다. AR 듀얼이란, 「D-게이저」와 「D-패드」를 사용하는 듀얼로, 이 두 가지를 통해 지면에서, 하늘에서, 그리고 건물 위에서도 몬스터가 현실에 튀어나와 맞부딪치는, 무지막지하게 박력 넘치는 듀얼이다! 이 마을에 사는 주인공 츠쿠모 유마도 이 듀얼에 열중하고 있지만, 실력은 초심자 수준의 연전연패 챔피언. 그러던 어느 날, 학교 제일의 불량배 료가와 듀얼로 승부를 내게 된 유마. 그리고 이 듀얼이, 유마의 운명을 크게 바꿔놓는다...! 결투 도중, 항상 유마의 꿈에 나타나던 불길한 문이 돌연 실체화된다. 굳게 닫혀 있던 그 문이 열리는 순간, 무수한 빛이 넘쳐나오고, 놀라서 옆을 올려다보니… 그곳에는 이세계에서 온 수수께끼의 생명체, 아스트랄이 서 있었다! 아스트랄의 잃어버린 기억, 99장의 넘버즈 카드를 되찾기 위해, 유마와 아스트랄은 함께 행동하기로 결심한다. 아스트랄이 나타난 진짜 이유는? 새로운 몬스터 **「넘버즈 몬스터」**의 정체는 무엇인가? 유마의 앞을 가로막는 강력한 라이벌들, 점차 밝혀지는 아스트랄의 수수께끼… 유마와 아스트랄의 콤비가 만들어가는 새로운 듀얼의 전설! 지금, 막이 오른다!!