머나먼 외딴 곳에는 하쿰 마을이라는 몬스터와 인간이 공존하고 교감을 나누며 인연을 맺고 유대를 가지는 오토몬 라이더가 되는 마을이 있다. 그 곳에는 주인공이자 세계 제일의 오토몬 라이더가 될 것이라 하는 류트와 소꿉친구인 슈발과 리리아 그리고 나비루가 있었다. 류트와 슈발, 리리아, 나비루는 오토몬으로 삼을 몬스터의 알을 찾으러 금지 구역까지 가고 아오아시라의 습격을 피하며 정체를 알 수 없는 아이루 모습의 석상 주변에서 알을 발견한다. 류트 일행은 리리아가 알고 있는 부화의 의식을 하였다. 그러다가 알이 부화하였다. 알에서 나온 몬스터는 하늘의 제왕, 리오레우스였다. 그리고 류트는 리오레우스에게 레우스라고 이름 지었고, 그렇게 류트와 레우스, 슈발, 리리아, 나비루의 모험은 시작된다.